Archaeplastida (classification phylogénétique)
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Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Archaeplastida (ou Plantae, ou encore Archéplastides), c'est-à-dire un arbre mettant en lumière les relations évolutives complexes (relations groupes ancestraux - groupes descendants) existantes entre les différents organismes vivants, ou taxa, constituant ce groupe. Du fait de ses méthodes nouvelles basées sur la biologie moléculaire, la phylogénie, science récente à l'origine de la classification phylogénétique du vivant, est en plein essor et parfois en contradiction avec l'ancienne classification classique, majoritairement basée, elle, sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi, certains points particuliers font parfois encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.
[modifier] Arbre phylogénétiqueConcernant les Embryophytes, l'arbre présenté ici suit assez fidèlement la synthèse des derniers travaux, présentée par l' Angiosperm Phylogeny Website. [modifier] LégendeLe symbole ▲ renvoie à la partie de l'arbre phylogénétique de l'évolution immédiatement supérieure. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré. [modifier] Arbre résumé_01_.jpg/40px-Archaeplastida_(arbre_résumé_mars2008)_01_.jpg){kind=small}
 ▲ └─o Archaeplastida │ ├─o Glaucophyta ou Glaucocystophyceae ► │ └─o Metabionta │ ├─o RHODOPHYTA ► │ └─o Chloroplastida ou Chlorobionta ou Viridiplantae │ ├─o CHLOROPHYTA ► │ └─o Streptophyta ou Charophyta │ ├─o Zygnematophyceae ► │ └─o Plasmodesmophyta ou Streptophytina ├─o Charophyceae └─o Embryophyta │ ├─o Marchantiophyta ou Hepaticophyta ► │ └─o Stomatophyta │ ├─o BRYOPHYTA ► │ └─o Tracheophyta ou Tracheobionta │ ├─o Lycophyta ou Lycopodiophyta ► └─o ├─o Monilophyta │ │ │ ├─o Equisetophyta ou Sphenophyta ► │ │ │ └─o FILICOPHYTA ou Polypodiidae ► │ └─o Spermatophyta │ ├─o MAGNOLIOPHYTA ou Angiospermae ► └─o ├─o Cycadophyta ► └─o ├─o Ginkgoales │ └─o Coniferophyta ou PINOPHYTA ► [modifier] Arbre développéArbre développé
_02_.jpg/40px-Archaeplastida_(arbre_développé_mars2008)_02_.jpg){kind=small}
▲ └─o Archaeplastida │ ├─o Glaucophyta ou Glaucocystophyceae ► │ └─o Metabionta │ ├─o RHODOPHYTA ► │ └─o Chloroplastida ou Chlorobionta ou Viridiplantae │ ├─o CHLOROPHYTA ► │ └─o Streptophyta ou Charophyta ├─? Mesostigmatophyceae └─o ├─o Chlorokybophyceae └─o ├─o Klebsormidiophyceae │ ├─o Klebsormidiaceae │ └─o Elakatotrichaceae └─o Phragmoplastophyta │ ├─o Zygnematophyceae ► │ └─o Plasmodesmophyta ou Streptophytina ├─o Charophyceae ou Charales ├─o Coleochaetales └─o Embryophyta │ ├─o Hepaticophyta ou Marchantiophyta ► │ └─o Stomatophyta │ ├─o BRYOPHYTA ► └─o ├─o Anthocerotophyta │ ├─o Leiosporocerotales ou Leiosporocerotaceae │ └─o Anthocerotopsida │ ├─o Anthocerotales ou Anthocerotaceae │ └─o Notothyladales │ ├─o Notothyladaceae │ │ ├─o Notothyladoideae │ │ └─o Phaeocerotoideae │ └─o Dendrocerotaceae │ ├─o Megacerotoideae │ └─o Dendrocerotoideae └─o Polysporangiophyta ├─o Horneophyttopsida (éteint) └─o ├─o Aglaophyton (éteint) └─o ├─o Rhyniopsida (éteint) └─o Tracheophyta ou Tracheobionta │ ├─o Lycophyta ou Lycopodiophyta ► └─o ├─o Eophyllophyton (éteint) ├─o Psilophyton (éteint) └─o Euphyllophyta ├─o Moniliformopsida ou Monilophyta │ ├─o Stauropteridales (éteint) │ └─o │ ├─o Zygopteridales ou Zygopteridaceae (éteint) │ │ ├─o Clepsydroideae (éteint) │ │ └─o Etapteroideae (éteint) │ ├─o │ │ ├─o Ophioglossopsida ou Ophioglossales │ │ └─o Psilopsida │ │ ├─? Barinophytales (éteint) │ │ └─o Psilotales │ └─o │ ├─o FILICOPHYTA ou Polypodiidae ► │ └─? │ ├─o Marattiales │ └─o │ ├─o Cladoxylales (éteint) │ │ │ └─o Equisetophyta ou Sphenophyta ► │ └─o Lignophyta ├─o Trimerophyta (éteint) └─o Spermatophyta ├─o Aneurophytales (éteint) ├─o Archaeopteridales (éteint) ├─o Protopityales (éteint) └─o Spermatopsida ├─o Calamopityaceae (éteint) ├─o Hydraspermaceae (éteint) └─o ├─o Lyginopteridaceae (éteint) └─o ├─o Medullosales (éteint) │ ├─o Potonieaceae (éteint) │ ├─o Alethopteridaceae (éteint) │ ├─o Neurodontopteridaceae (éteint) │ └─o Cyclopteridaceae (éteint) └─o ├─o │ ├─o Callistophyta (éteint) │ └─o Glossophyta │ ├─o Glossopteridaceae (éteint) │ ├─o Czekanowskiaceae (éteint) │ ├─o Peltaspermales (éteint) │ │ ├─o Peltaspermaceae (éteint) │ │ └─o Corystospermaceae (éteint) │ ├─o Caytoniaceae (éteint) │ ├─o Gigantonomiaceae (éteint) │ └─o │ ├─o Pentoxylales (éteint) │ └─o │ ├─o Bennettitales ou Cycadeoidales (éteint) │ │ │ └─o MAGNOLIOPHYTA ou Angiospermae ► └─o ├─o Cycadophyta ► └─o ├─o Ginkgoales │ ├─o Karkeniaceae (éteint) │ └─o Ginkgoaceae │ └─o Coniferophyta ou PINOPHYTA ► [modifier] Débat scientifique relatif à la phylogénie des ArchaeplastidaDans l'arbre ci-dessus, les principales questions qui font débat sont :
[modifier] Classification selon Cavalier-Smith 1998Cette classification n'est pas à proprement parler phylogénétique. Basée sur les nouvelles phylogénies, elle maintient néanmoins des taxons paraphylétiques, notamment à la base des lignées évolutives, par commodité. Elle maintient également les niveaux traditionnels de classification (règnes, phyla, classes, etc.). Classification selon Cavalier-Smith 1998
▲ └─o règne des Plantae ├─o sous-règne des Biliphyta (peut-être paraphylétique) │ ├─o infra-règne des Glaucophyta │ │ └─o embranchement des Glaucophyta │ └─o infra-règne des Rhodophyta │ └─o embranchement des Rhodophyta │ ├─o sous-embranchement des Rhodellophytina (peut-être paraphylétique) │ │ └─o classe des Rhodellophyceae │ └─o sous-embranchement des Macrorhodophytina │ ├─o classe des Bangiophyceae │ └─o classe des Floridiophyceae └─o sous-règne des Viridaeplantae ou Viridiplantae ├─o infra-règne des Chlorophyta │ └─o embranchement des Chlorophyta │ ├─o sous-embranchement des Chlorophytina │ │ ├─o infra-embranchement des Prasinophytae (paraphylétique) │ │ │ ├─o classe des Micromonadophyceae │ │ │ │ ├─o ordre des Mamiellales │ │ │ │ ├─o ordre des Pyramimonadales │ │ │ │ └─o ordre des Mesostigmatales │ │ │ └─o classe des Nephrophyceae │ │ └─o infra-embranchement des Tetraphytae │ └─o sous-embranchement des Phragmophytina │ ├─o infra-embranchement des Charophytae │ │ └─o classe des Charophyceae │ │ └─o ordre des Charales │ └─o infra-embranchement des Rudophytae │ ├─o classe des Eophyceae │ │ ├─o sous-classe des Stichophycidae │ │ │ ├─o ordre des Chlorokybales │ │ │ └─o ordre des Klebsormidiales │ │ └─o sous-classe des Chaetophycidae │ │ └─o ordre des Coleochaetales │ └─o classe des Conjugophyceae │ ├─o ordre des Desmidiales │ └─o ordre des Zygnematales └─o infra-règne des Cormophyta ├─o embranchement des Bryophyta │ ├─o sous-embranchement des Hepaticae │ ├─o sous-embranchement des Anthocerotae │ └─o sous-embranchement des Musci │ ├─o infra-embranchement des Sphagneae │ └─o infra-embranchement des Bryatae └─o embranchement des Tracheophyta ├─o sous-embranchement des Pteridophytina (paraphylétique) │ ├─o infra-embranchement des Psilophytae │ ├─o infra-embranchement des Lycophytae │ ├─o infra-embranchement des Sphenophytae │ └─o infra-embranchement des Filices (peut-être paraphylétique) └─o sous-embranchement des Spermatophytina ├─o infra-embranchement des Gymnospermae └─o infra-embranchement des Angiospermae [modifier] Arbre phylogénétique simplifié selon Nozaki et al. 2003L'analyse portait essentiellement sur les organismes à plastes, les Discicristés, Straménopiles et Alvéolés se retrouvant à l'intérieur d'un vaste clade rendant les Archaeplastida paraphylétiques. Les Rhodophytes seraient la lignée la plus proche de la base des Bicontes (sous réserve de la place indéterminée des organismes sans mitochondrie). La place des Rhizariens n'est pas évoquée. Arbre phylogénétique simplifié selon Nozaki et al. 2003
└─o Plantae ├─o Rhodophyta └─o ├─o Glaucophyta └─o ├─o Viridiplantae └─o ├─o Discicristata │ ├─o Heterolobosea │ └─o │ ├─o Kinetoplastida │ └─o Euglenozoa └─o Chromalveolata ├─o Heterokontophyta └─o Alveolata ├─o Apicomplexa └─o Ciliophora [modifier] Classification proposée par Adl et al. 2005Ce comité a proposé une nouvelle classification, remplaçant celle des anciens Protistes et tenant compte des phylogénies moléculaires récentes. Elle regroupe les Eucaryotes en six groupes réputés monophylétiques. Voici ce qui concerne les Archaeplastida. Classification proposée par Adl et al. 2005
▲ └─o Archaeplastida ├─o Glaucophyta ├─o Rhodophyceae └─o Chloroplastida ├─o Chlorophyta │ ├─o Ulvophyceae │ ├─o Trebouxiophyceae │ └─o Chlorophyceae ├─o Chlorodendrales ├─o Prasinophytae (paraphylétique) ├─o Mesostigma └─o Charophyta └─o Streptophytina ├─o Charales └─o Plantae [modifier] En savoir plus[modifier] Sources bibliographiques de référence
[modifier] Autres sources bibliographiques[modifier] Sources internet
[modifier] Liens internes
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