Relation entre génomique, transcriptomique et protéomique
Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre.
 |
Cette page est en cours de réécriture ou de restructuration importante.
Vous êtes invité à en discuter en page de discussion et à participer à son amélioration en apportant des modifications.
Consultez l’historique des modifications pour voir les modifications récentes. |
 |
Cet article est une ébauche concernant la Protéomique.
Vous pouvez partager vos connaissances en l’améliorant. (Comment ?).
|
Il existe des points communs entre la génomique, la transcriptomique et la protéomique. Mais elles se distinguent sur de nombreux points.
[modifier] Points communs
- Etudier l'ensemble des gènes, transcrits et protéines d'un organisme.
- Les techniques de transcriptomique sont très proches des techniques de génomique. En fait, la première étape de la transcriptomique consiste à réaliser une transcription inverse pour transcrire de l'ARN en ADN. Les techniques d'identification, d'amplification, de clonage et d'expression sont ensuite identiques.
- Les protéines et les transcrits possèdent la même variabilité en fonction de l'environnement cellulaire. Régulation au niveau de la synthèse des ARN et des protéines.
[modifier] Différences
- Malgré les ressemblances qui existent entre les techniques de génomiques et transcriptomiques, le sujet d'étude est différent.
- Le génome est principalement fixé dans le temps, dans les différents tissus (sauf modifications épigénétiques) et spécifique d'un individu/organisme. Le transcriptome varie en fonction du temps, du tissu ou type cellulaire, de l'environnement.
- Le génome est constitué de chromosomes peu nombreux et de grande taille, formés eux-mêmes d'ADN. Le transcriptome est formé de fragments d'ARN de petite taille, très nombreux, et très hétérogènes.
- il existe une plus grande variabilité des protéines par rapport aux transcrits
- plus de modifications post-traductionnelles (clivage protéolytique, modification d'acides aminés, ajout de groupes phosphates/glucidiques/lipidiques, etc.) que de modifications post-transcriptionnelles (épissage, modification de nucléotides)
- Les protéines ont plus de fonctions que les transcrits (peu de transcrit ARN ont une activité
(sauf ARN interférents, auto-épissage, etc.)
