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J'ai déplacé le paragraphe suivant car il me semble racolleur. En particulier il faudrait préciser l'influence du mode de production sur les pb causés par la thalidomide.

ske 21 jul 2004 à 18:32 (CEST)

L'époque où on extrayait de plantes ou d'organes animaux les molécules susceptibles d'être utilisées en particulier en thérapeutique est révolue et l'époque où on pensait par la chimie produire directement ces molécules a conduit à des dégats certains (la thalidomide). On charge donc par ce procédé, la PCR, des bactéries de faire croitre exponentiellement le nombre de molécules identiques à la molécule que l'on a sélectionné.

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Ce ne serait pas plutôt :

réaction d'amplification en chaîne par polymérase ? ou réaction en chaîne par polymérase? -- Looxix

[modifier] Abstract

Voici un chapitre déplacé depuis l'article, à traduire

The PCR (Polymerase Chain Reaction) is a process for an exponential amplification in vitro of a defined DNA sequence from a little number of genetic equipment thanks to the Taq-polymérase. This technique allows the multiplication of the target sequence in a few times (near one million copies in several hours). The PCR is a great revolution in molecular biology, in particular since the Taq-polymerase isolation, which resists to high temperatures. This technique can be qualitative or quantitative, so, it is more precise. In the last case, all stages, studed in real time witn a computer, are produced in a sheet with 96 shafts or in a capillary, put into a thermocycler with a variable temperature. This thermocycler allow an automation of the technique. Each cycle is made of 3 stages with different temperatures:

• Dénaturation : the DNA strands are dissociated by high temperature (near 95°C)
• Primers hybridation on a DNA fragment (50-60°C)
• Extension : the strands are synthesized from primers hybridation (near 72°C)

The target sequence is doubled in each cycle, according to an amplification theoretical rate of 2ⁿ.

The PCR quantification is maded by two techniques, based on fluorescence:

• SYBR Green I, which become fluorescent when it is intercaled between the DNA nucleotids during extension.
• the oligonucléotidic fluorescent probes for hybridation for « Quenching », with the FRET (fluorescence transfert) and the TaqMan technique.

There are a lot of PCR applications: in fundamental research, in medicine, in routine medical, criminology, food processing industry …

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[modifier] SYBR green

Je ne pense pas que le sybr green soit à proprement parlé un intercalant. Il me semble me souvenir qu'il s'insère dans le petit sillon de l'ADN. Une confirmation ?

Oui, le SYBR green et le BOXTO sont des cyanines asymétriques et il est fortement suspecté (mais je crois non démontré) qu'elles s'insèrent dans le petit sillon. J'ai parler abusivement d'intercalant par soucis de simplification et parce que j'envisage une refonte de l'organisation de l'article. --Ygonaar 4 mars 2006 à 11:29 (CET)

[modifier] Projet de refonte de la page PCR

Bonjour, vous avez peut-être constaté que je faisais d'importante modification sur cet article. Je n'avais pas encore adresser de message sur la page de discussion car je suis un wikipediste débutant. Je vous expose maintenant ce que j'envisage:

Une page assez pointue sur les principes généraux de la PCR, avec un bref chapitre Définition en en-tête, puis un chapitre Historique(une évolution majeure par ligne avec uniquement la date et le premier auteur de la parution correspondante qui se trouvera dans le chapitre Bibliographie) , afin d'être plus simple et claire.

Viendront ensuite le chapitre Principes, Cinétique d'une PCR, Utilité et techniques associées, Définitions (dNTP, amorces, etc.), Bibliographie, et Liens (dont un lien vers l'article en anglais lorsqu'il existe)

Je compte faire, où refondre, un certains nombre de page qui devraient garder une homologie de structure. Par soucis de didactisme, certaines informations se verront éliminer de la page PCR pour se retrouver dans une page annexe. Le plan général devrait ressembler à ceci (il se peut que certaine page existe déja, je n'ai pas encore tout vérifié) : PCR (article corps)

thermocycleur (dont peut être deux tableaux (thermocycleurs classiques et en temps réel) avec les différentes machines, quelques caractéristiques et un lien vers les fabriquants).

PCR en point final (avec principe mathématique, lien vers électrophorese , etc.)

PCR en temps réel (avec principe mathématique CT et Maxima de Dérivée Seconde)

Agent fluorescent en PCR (BET, SYBR green, Beacon, Scorpion, LightUp, etc. avec schémas lors de la poymérisation)

PCR quantitative (PCR en temps réel, avec compétiteur, etc?)

Un articles par types de PCR (multiplexe, nested, inverse, etc.)

Transcription inverse

RT-PCR (avec les limites actuelles pour la RT-PCR compétitive)

Qualité des ARN (avec extraction, stockage, électrophorèse cappilaire, etc.)

Et quand tout sera fini, mettre des liens sur les articles en anglais pour que les wikipédistes viennent compléter leurs connaissances sur les pages françaises! Et qu'ils améliorent les pages anglaises bien entendue...

Voila en gros, dites-moi ce que vous en pensez. Vous avez dû remarquer que je suis pathologiquement incapable de relire mes propres fautes. N'hésitez donc pas à me corriger! --Ygonaar 4 mars 2006 à 12:13 (CET)

Ca a l'air super tout ça !!... Bonnes idées et un découpage de l'ensemble cohérent. S'il me vient des réflexions, je te fais signe. En attendant, bon courage pour cette entreprise !... Elapied 15 mars 2006 à 00:51 (CET)