BRENDA
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BRENDA est la banque de données intuitive d'informations sur les enzymes. Cette banque de données est entretenue et développée par l'Institut de biochimie de l'Université de Cologne. Les données sur les fonctions enzymatiques sont extraites directement de la littérature primaire. Des vérifications formelles ainsi que des vérifications de cohérence sont effectuées par des programmes informatiques ; de plus chacune des données introduites est vérifiée "manuellement". La dernière révision remonte à janvier 2004 et comprenait :
- Importante accélération de la vitesse de mise à jour
- Développement d'un nouveau fureteur de l'arborescence EC
- Fureteur de l'arborescence de la taxonomie
- Moteur de recherche des sous-structures chimiques pour les structures des ligands
- Développement d'un vocabulaire contrôlé
- Ontologie de certains champs d'information
- Lexique des noms de ligands.
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[modifier] Utilisation
[modifier] Autres banques de données
[modifier] Références
- Springer Handbook of Enzymes,Schomburg, D., Schomburg, I. (2001) 2nd Ed. Springer, Heidelberg
- Enzyme data and metabolic information: BRENDA, a resource for research in biology, biochemistry, and medicine Schomburg, I., Hofmann, O., Bänsch, C., Chang, A., Schomburg, D. Gene Funct. Dis. (2000) 3-4, 109-18
- BRENDA, enzyme data and metabolic information. Schomburg, I., Chang, A., Schomburg, D.Nucleic Acids Res. (2002) 30, 47-9
- BRENDA: a resource for enzyme data and metabolic information. Schomburg I., Chang A., Hofmann O., Ebeling C., Ehrentreich F., Schomburg D.Trends Biochem Sci. 2002 Jan;27(1):54-6.
- Review of the BRENDA Database. Pharkya P., Nikolaev E.V., Maranas C.D. Metab Eng. 2003 Apr;5(2):71-3.
- BRENDA, the enzyme database: updates and major new developments. Schomburg I., Chang A., Ebeling C., Gremse M., Heldt C., Huhn G., Schomburg D. Nucleic Acids Res. 2004 Jan 1;32 Database issue:D431-3.
