Électrophorèse sur gel en gradient dénaturant
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La DGGE (Denaturing gradient gel electrophoresis) est une technique d'électrophorèse permettant la séparation de molécules d'acides nucléiques (ADN ou ARN) de même taille. Son principe consiste à déposer un échantillon d'acide nucléique sur un gel d'électrophorèse contenant un agent dénaturant (par exemple l'urée). Dans un gel DGGE, les fragments d'acide nucléique sont soumis à différentes concentration du dénaturants. Lorsque le Tm (Tm: melting température) caractérisant le domaine de fusion du fragment le plus bas est atteint, le fragment se dénature partiellement, ce qui stoppe sa migration (Ercolini, 2004).
[modifier] Applications
- Analyse de la diversité du gène de l'ARN ribosomal (16S ou 18S) de populations microbiennes naturelles (sol, milieux aquatiques)[1].
[modifier] Bibliographie
- Ercolini, D., 2004. PCR-DGGE fingerprinting: novel strategies for detection of microbes in food. J Microbiol Methods. 56(3):297-314. Review. PMID: 14967221 [PubMed - indexed for MEDLINE]
[modifier] Références
- ↑ Muyzer, G. 1999. DGGE/TGGE a method for identifying genes from natural ecosystems. Current opinion in Microbiology 2: 317-22.
