SINE

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Les séquences SINE (Short-INterspersed-nuclear-Element) font partie des séquence répétitives au sein de l'ADN. Parmi les plus connues de ces séquences, on trouve les séquences Alu qui contiennent le site de restriction (AG/CT) de l'enzyme Alu I, d'où leur nom.

D'une taille de 300 pb (paire de bases). Ils sont représentés chez les primates par les séquences alu (spécifiques de l'espèce) présentes sous forme de 1.500.000 copies dans le génome humain représentant 13% du génome total (une toutes les 4 kb). Elles représentent des séquences rétro-transcription mais ne comportent pas de séquences codant pour une transcriptase inverse et doivent donc être rétrotranscrites par une transcriptase agissant en trans. Les séquences alu qui sont dispersées dans les introns pourraient jouer un rôle dans la recombinaison.