Rhizaria (classification phylogénétique)
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Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Rhizaria (ou rhizariens), c'est-à-dire un arbre mettant en lumière les relations évolutives complexes (relations groupes ancestraux - groupes descendants) existantes entre les différents organismes vivants, ou taxa, constituant ce groupe. Du fait de ses méthodes nouvelles basées sur la biologie moléculaire, la phylogénie, science récente à l'origine de la classification phylogénétique du vivant, est en plein essor et parfois en contradiction avec l'ancienne classification classique, majoritairement basée, elle, sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi, certains points particuliers font parfois encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.
[modifier] Arbre phylogénétique[modifier] Arbre résumé▲ └─o Rhizaria ├─o Radiozoa │ ├─o Polycystinea │ │ ├─o Nasselaria │ │ └─o Spumellaria │ └─o Spasmaria │ ├─o Sticholonchea ou Taxopodida │ └─o Acantharea └─o ├─o │ ├─o Phytomyxea │ │ ├─o Phagomyxida │ │ └─o Plasmodiophorida │ └─o Cercozoa │ ├─? Proteomyxea │ │ ├─? Vampyrellida │ │ └─o Proteomyxida │ └─o │ ├─o Chlorarachnea ou Chlorarachniophyta │ └─o │ ├─o Sarcomonadea │ │ └─o Cercomonadida │ ├─? Metromonadida │ ├─? Thecofilosa │ │ ├─o │ │ │ ├─o Cryomonadida │ │ │ └─o Ebriidae │ │ └─o Tectofilosida │ ├─o Silicofilosea ou Imbricatea │ │ ├─o Thaumatomonadida ou Thaumatomastigidae │ │ └─o Euglyphida │ └─o Phaeodarea └─o ├─o Gromiidae └─o ├─o Ascetosporea │ ├─o Paramyxea │ ├─o Claustrosporidiidae │ └─o Haplosporidia └─o Foraminifera ├─o │ ├─? Xenophyophorea │ ├─o Allogromiida │ └─o Astrorhizida ├─o Involutinida (éteint) ├─o Carterinida ├─o │ ├─o Silicoloculinida │ ├─o Spirillinida │ ├─o Miliolida │ └─o Fusulinida (éteint) └─o ├─o Lagenida ├─o Globigerinida ├─o Robertinida ├─o Textulariida └─o Rotaliida [modifier] Arbre phylogénétique développé▲ └─o Rhizaria ├─o Radiozoa │ ├─o Polycystinea │ │ ├─o Nasselaria │ │ │ ├─o Plagoniidae │ │ │ ├─o Acanthodesmiidae │ │ │ ├─o Theoperidae │ │ │ ├─o Carpocaniidae │ │ │ ├─o Pterocorythidae │ │ │ ├─o Artostrobiidae │ │ │ └─o Cannobotryidae │ │ └─o Spumellaria │ │ ├─o Thalassicollidae │ │ ├─o Collozoidae │ │ ├─o Collosphaeridae │ │ ├─o Actinommidae │ │ ├─o Phacodiscidae │ │ ├─o Coccodiscidae │ │ ├─o Spongodiscidae │ │ ├─o Pyloniidae │ │ ├─o Tholoniidae │ │ └─o Litheliidae │ └─o Spasmaria │ ├─o Sticholonchea ou Taxopodida │ └─o Acantharea │ ├─o Holacanthida │ │ ├─o Acanthochiasmidae │ │ ├─o Acanthoplegmidae │ │ └─o Acanthocollidae │ └─o │ ├─o Symphyacanthida │ │ ├─o Amphilithiidae │ │ ├─o Astrolithidae │ │ └─o Pseudolithiidae │ └─o │ ├─o Chaunacanthida │ │ ├─o Gigartacontidae │ │ ├─o Conaconidae │ │ └─o Stauraconidae │ └─o Arthracanthida │ ├─o Phyllacantha │ │ ├─o Phyllostauridae │ │ ├─o Stauracanthidae │ │ └─o Dictyacanthidae │ └─o Sphaenacantha │ ├─o Acanthometridae │ ├─o Dorataspididae │ ├─o Phractopeltidae │ ├─o Diploconidae │ ├─o Lithopteridae │ └─o Hexalaspididae └─o ├─o │ ├─o Phytomyxea │ │ ├─o Phagomyxida │ │ └─o Plasmodiophorida │ │ ├─o Plasmodiophoridae │ │ └─o Endemosarcidae │ └─o Cercozoa │ ├─? Proteomyxea │ │ ├─? Vampyrellida │ │ │ ├─? Hyalodiscidae │ │ │ └─o Vampyrellidae │ │ └─o Proteomyxida │ │ ├─? Desmothoracida ou Clathrulinidae │ │ ├─o Pseudosporida │ │ ├─o Reticulosida ou Gymnophryidae │ │ └─o Leucodictyida │ │ ├─o Leucodictyidae │ │ └─o Massisteriidae │ └─o │ ├─o Chlorarachnea ou Chlorarachniophyta │ └─o │ ├─o Sarcomonadea │ │ ├─? Metopiidae │ │ └─o Cercomonadida │ │ ├─o Cercomonadidae │ │ └─o Heteromitidae │ ├─? Metromonadida │ ├─? Thecofilosa │ │ ├─o │ │ │ ├─o Cryomonadida │ │ │ └─o Ebriidae │ │ └─o Tectofilosida │ │ ├─o Chlamydophryidae │ │ ├─o Psammonobiotidae │ │ ├─o Amphitremidae │ │ ├─o Volutellidae │ │ └─o Pseudodifflugiidae │ ├─o Silicofilosea ou Imbricatea │ │ ├─o Thaumatomonadida ou Thaumatomastigidae │ │ └─o Euglyphida │ │ ├─o Euglyphidae │ │ ├─o Trinematidae │ │ ├─o Cyphoderiidae │ │ └─o Paulinellidae │ └─o Phaeodarea │ ├─o Phaeodendrida ou Coelodendridae │ ├─o Phaeoconchida ou Concharidae │ ├─o Phaeogromida │ │ ├─o Challengeridae │ │ ├─o Medusettidae │ │ └─o Lirellidae │ ├─o Phaeosphaerida │ │ ├─o Aulosphaeridae │ │ ├─o Cannosphaeridae │ │ └─o Sagosphaeridae │ ├─o Phaeocystida │ │ ├─o Aulacanthidae │ │ └─o Astracanthidae │ ├─o Phaeogymnocellida │ │ ├─o Phaeosphaeridae │ │ ├─o Phaeodinidae │ │ └─o Atlanticellidae │ └─o Phaeocalpida │ ├─o Castanellidae │ ├─o Circoporidae │ ├─o Tuscaroridae │ ├─o Porospathidae │ └─o Polypyramidae └─o ├─o Gromiidae └─o ├─o Ascetosporea │ ├─o Paramyxea │ │ ├─o Paramyxidae │ │ └─o Marteiliidae │ ├─o Claustrosporidiidae │ └─o Haplosporidia │ ├─o Bonamia │ ├─o Nephridiophagidae │ ├─o Urosporidiidae │ └─o Haplosporidiidae └─o Foraminifera ├─o Biomyxidae ├─o │ ├─? Xenophyophorea │ │ ├─o Paleodictyon (éteint) │ │ ├─? Ammoclathrinidae │ │ ├─o Stannomida │ │ │ ├─o Stannomidae │ │ │ └─o Pelosinidae │ │ └─o Psamminida │ │ ├─o Psammettidae │ │ ├─o Psamminidae │ │ ├─o Syringamminidae │ │ └─o Cerelasmidae │ ├─o Allogromiida │ │ ├─o Lagynidae │ │ ├─o Hospitellidae │ │ ├─o Allogromiidae │ │ └─o Shepheardellidae │ └─o Astrorhizida │ ├─o Komokiacea │ │ ├─o Komokiidae │ │ └─o Baculellidae │ ├─o Hippocrepinacea │ ├─o Ammodiscacea │ └─o Astrorhizacea │ ├─o Astrorhizidae │ ├─o Bathysiphonidae │ ├─o Rhizamminidae │ ├─o Schizamminidae │ ├─o Psammosphaeridae │ ├─o Saccamminidae │ ├─o Hemisphaeramminidae │ └─o Polysaccamminidae ├─o Involutinida (éteint) │ ├─o Planispirillinidae (éteint) │ ├─o Ventrolaminidae (éteint) │ ├─o Hirsutospirellidae (éteint) │ └─o Involutinidae (éteint) │ ├─o Aulotortinae (éteint) │ ├─o Involutininae (éteint) │ ├─o Triadodiscinae (éteint) │ └─o Triasininae (éteint) ├─o Carterinida ├─o │ ├─o Silicoloculinida │ ├─o Spirillinida │ │ ├─o Spirillinidae │ │ └─o Patellinidae │ ├─o Miliolida │ │ ├─o Squamulinidae │ │ ├─o Keramosphaeridae │ │ ├─o Cornuspiridae │ │ ├─o Hemigordiopsidae │ │ ├─o Fischerinidae │ │ ├─o Nubeculariidae │ │ ├─o Riveroinidae │ │ ├─o Ophthalmidiidae │ │ ├─o Spiroloculinidae │ │ ├─o Hauerinidae │ │ ├─o Miliolidae │ │ ├─o Alveolinidae │ │ ├─o Peneroplidae │ │ ├─o Discospirinidae │ │ └─o Soritidae │ └─o Fusulinida (éteint) │ ├─o Archaediscacea (éteint) │ │ ├─o Lasiodiscidae (éteint) │ │ └─o Archaediscidae (éteint) │ │ ├─o Archaediscinae (éteint) │ │ └─o Asteroarchaediscinae (éteint) │ ├─o Colaniellacea (éteint) │ ├─o Earlandiacea (éteint) │ │ ├─o Earlandiidae (éteint) │ │ ├─o Pseudoammodiscidae (éteint) │ │ └─o Pseudolituotubidae (éteint) │ ├─o Endothyracea (éteint) │ │ ├─o Bradyinidae (éteint) │ │ └─o Endothyridae (éteint) │ │ ├─o Endostaffellinae (éteint) │ │ ├─o Endothyranopsinae (éteint) │ │ ├─o Endothyrinae (éteint) │ │ └─o Haplophragmellinae (éteint) │ ├─o Geinitzinacea (éteint) │ │ ├─o Geinitzinidae (éteint) │ │ └─o Pachyphloiidae (éteint) │ ├─o Moravamminacea (éteint) │ │ ├─o Caligellidae (éteint) │ │ ├─o Moravamminidae (éteint) │ │ └─o Paratikhinellidae (éteint) │ ├─o Nodosinellacea (éteint) │ │ ├─o Earlandinitidae (éteint) │ │ └─o Nodosinellidae (éteint) │ ├─o Ptychocladiacea (éteint) │ ├─o Tetrataxacea (éteint) │ │ ├─o Abadehellidae (éteint) │ │ ├─o Pseudotaxidae (éteint) │ │ ├─o Tetrataxidae (éteint) │ │ └─o Valvulinellidae (éteint) │ ├─o Tournayellacea (éteint) │ │ ├─o Palaeospiroplectamminidae (éteint) │ │ │ ├─o Endospiroplectammininae (éteint) │ │ │ └─o Palaeospiroplectammininae (éteint) │ │ └─o Tournayellidae (éteint) │ │ ├─o Chernyshinellinae (éteint) │ │ ├─o Forschinae (éteint) │ │ ├─o Lituotubellinae (éteint) │ │ ├─o Septabrunsiininae (éteint) │ │ └─o Tournayellinae (éteint) │ ├─o Palaeotextulariacea (éteint) │ │ ├─o Palaeotextulariidae (éteint) │ │ ├─o Semitextulariidae (éteint) │ │ │ ├─o Koskinobigenerininae (éteint) │ │ │ ├─o Pseudopalmulinae (éteint) │ │ │ └─o Semitextulariinae (éteint) │ │ └─o Biseriamminidae (éteint) │ │ ├─o Biseriammininae (éteint) │ │ ├─o Dagmaritinae (éteint) │ │ ├─o Lousettitinae (éteint) │ │ └─o Sideriammininae (éteint) │ ├─o Parathuramminacea (éteint) │ │ ├─o Archaesphaeridae (éteint) │ │ │ ├─o Archaesphaerinae (éteint) │ │ │ └─o Insolentithecinae (éteint) │ │ ├─o Auroriidae (éteint) │ │ ├─o Chrysothuramminidae (éteint) │ │ ├─o Eovolutinidae (éteint) │ │ ├─o Ivanovellidae (éteint) │ │ ├─o Marginaridae (éteint) │ │ ├─o Tuberitinidae (éteint) │ │ ├─o Uralinellidae (éteint) │ │ ├─o Usloniidae (éteint) │ │ └─o Parathuramminidae (éteint) │ │ ├─o Irregularininae (éteint) │ │ └─o Parathurammininae (éteint) │ └─o Fusulinacea (éteint) │ ├─o Fusulinidae (éteint) │ │ ├─o Eofusulininae (éteint) │ │ ├─o Fusulinellinae (éteint) │ │ ├─o Fusulininae (éteint) │ │ └─o Wedekindellininae (éteint) │ ├─o Loeblichiidae (éteint) │ │ ├─o Loeblichiinae (éteint) │ │ └─o Nanicellinae (éteint) │ ├─o Neoschwagerinidae (éteint) │ │ ├─o Neoschwagerininae (éteint) │ │ ├─o Sumatrininae (éteint) │ │ └─o Thailandininae (éteint) │ ├─o Ozawainellidae (éteint) │ │ ├─o Ozawainellinae (éteint) │ │ └─o Pseudostaffellinae (éteint) │ ├─o Schubertellidae (éteint) │ │ ├─o Boultoniinae (éteint) │ │ └─o Schubertellinae (éteint) │ ├─o Schwagerinidae (éteint) │ │ ├─o Biwaellinae (éteint) │ │ ├─o Chusenellinae (éteint) │ │ ├─o Polydiexodininae (éteint) │ │ ├─o Pseudoschwagerininae (éteint) │ │ └─o Schwagerininae (éteint) │ ├─o Staffellidae (éteint) │ └─o Verbeekinidae (éteint) │ ├─o Kahlerininae (éteint) │ ├─o Misellininae (éteint) │ ├─o Pseudodoliolininae (éteint) │ └─o Verbeekininae (éteint) └─o ├─o Lagenida │ ├─o Lagenidae │ ├─o Glandulinidae │ ├─o Nodosariidae │ ├─o Vaginulinidae │ └─o Polymorphinidae ├─o Globigerinida │ ├─o Candeinacea │ │ ├─o Globigerinitidae │ │ └─o Candeinidae │ └─o Globigerinacea │ ├─o Hastigerinidae │ ├─o Sphaeroidinellidae │ ├─o Globigerinidae │ ├─o Pulleniatinidae │ ├─o Orbulinidae │ ├─o Globorotaliidae │ └─o Turborotalitidae ├─o Robertinida │ ├─o Robertinidae │ ├─o Ceratobuliminidae │ └─o Epistominidae ├─o Textulariida │ ├─o Hormosinidae │ ├─o Telamminidae │ ├─o Rzehakinidae │ ├─o Ammosphaeroidinidae │ ├─o Haplophragmoididae │ ├─o Sphaeramminidae │ ├─o Lituotubidae │ ├─o Lituolidae │ ├─o Placopsilinidae │ ├─o Cyclamminidae │ ├─o Spiroplectamminidae │ ├─o Trochamminidae │ ├─o Remaneicidae │ ├─o Verneuilinidae │ ├─o Globotextulariidae │ ├─o Eggerellidae │ ├─o Textulariidae │ └─o Valvulinidae └─o Rotaliida ├─? Placentulinidae ├─? Ungulatellidae ├─? Pannellainidae ├─? Pegidiidae ├─? Sphaeroidinidae ├─o Loxostomatacea │ ├─o Bolivinellidae │ ├─o Tortoplectellidae │ └─o Tosaidae ├─o Stilostomellacea ├─o Bolivinacea │ ├─o Bolivinidae │ └─o Bolivinitidae ├─o Fursenkoinacea ├─o Virgulinellacea ├─o Pleurostomellacea ├─o Cassidulinacea │ ├─o Caucasinidae │ ├─o Delosinidae │ └─o Cassidulinidae ├─o Buliminacea │ ├─o Stainforthiidae │ ├─o Buliminidae │ ├─o Buliminellidae │ ├─o Uvigerinidae │ ├─o Siphogenerinoididae │ ├─o Reussellidae │ ├─o Trimosinidae │ ├─o Pavoninidae │ └─o Millettiidae ├─o Siphoninacea ├─o Annulopatellinacea ├─o Glabratellacea │ ├─o Buliminoididae │ ├─o Heronalleniidae │ ├─o Rotaliellidae │ └─o Glabratellidae ├─o Rosalinacea │ ├─o Heleninidae │ ├─o Rosalinidae │ ├─o Bagginidae │ ├─o Mississippinidae │ ├─o Bueningiidae │ └─o Bronnimanniidae ├─o Discorbinellacea │ ├─o Parrelloididae │ ├─o Pseudoparrellidae │ ├─o Planulinoididae │ └─o Discorbinellidae ├─o Planorbulinacea │ ├─o Planulinidae │ ├─o Bisacciidae │ ├─o Cibicididae │ ├─o Planorbulinidae │ ├─o Cymbaloporidae │ └─o Victoriellidae ├─o Acervulinacea │ ├─o Acervulinidae │ └─o Homotrematidae ├─o Asterigerinacea │ ├─o Epistomariidae │ ├─o Alfredinidae │ ├─o Asterigerinatidae │ ├─o Asterigerinidae │ └─o Amphisteginidae ├─o Nonionacea │ ├─o Nonionidae │ ├─o Spirotectinidae │ └─o Almaenidae ├─o Nummulitacea ├─o Rotaliacea │ ├─o Miogypsinidae (éteint) │ ├─o Elphidiidae │ ├─o Calcarinidae │ ├─o Rotaliidae │ ├─o Discorbidae │ └─o Eponididae └─o Chilostomellacea ├─o Karreriidae ├─o Chilostomellidae ├─o Quadrimorphinidae ├─o Alabaminidae ├─o Osangulariidae ├─o Oridorsalidae ├─o Heterolepidae ├─o Gavelinellidae └─o Trichohyalidae |
 
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[modifier] Débat scientifique relatif à la phylogénie des Rhizaria
[modifier] Classification proposée par Adl et al. 2005
Ce comité a proposé une nouvelle classification, remplaçant celle des anciens Protistes et tenant compte des phylogénies moléculaires récentes. Elle regroupe les Eucaryotes en six groupes réputés monophylétiques. Voici ce qui concerne les Rhizaria.
Classification proposée par Adl et al. 2005
▲ └─o Rhizaria ├─o Cercozoa │ ├─o Cercomonadida │ │ ├─o Cercomonadidae (peut-être paraphylétique) │ │ └─o Heteromitidae │ ├─o Silicofilosea │ │ ├─o Thaumatomonadida │ │ └─o Euglyphida │ │ ├─o Euglyphidae │ │ ├─o Trinematidae │ │ ├─o Cyphoderiidae │ │ ├─o Paulinellidae │ │ └─? Ampullataria, Euglyphidion, Heteroglypha, Matsakision │ ├─o Chlorarachniophyta │ ├─o Phytomyxea │ ├─o Phaeodarea │ │ ├─o Phaeoconchia │ │ ├─o Phaeocystina │ │ ├─o Phaeogromia │ │ └─o Phaeosphaeria │ ├─o Nucleohelea │ │ ├─o Clathrulinidae │ │ └─o Gymnosphaerida │ └─? Cryothecomonas, Gymnophrys, Lecythium, Massisteria, Metopion, Proleptomonas, Pseudodifflugia ├─o Haplosporidia ├─o Foraminifera ├─o Gromia └─o Radiolaria ├─o Polycystinea │ ├─o Spumellaria │ │ ├─o Collodaria │ │ └─o Sphaerellaria │ └─o Nassellaria │ ├─o Plectellaria │ └─o Cyrtellaria ├─o Sticholonche └─o Acantharia ├─o Arthracanthida ├─o Chaunocanthida ├─o Holocanthida └─o Symphyacanthida
[modifier] En savoir plus
[modifier] Sources bibliographiques de référence
- David Bassa, David Moreira, Purificación López-García, Stephane Polet, Ema E. Chao, Sophie von der Heyden, Jan Pawlowski et Thomas Cavalier-Smith (2005) « Polyubiquitin Insertions and the Phylogeny of Cercozoa and Rhizaria », Protist 156, p. 149-161
[modifier] Autres sources bibliographiques
[modifier] Sources internet
[modifier] Liens internes
- Rhizaria -- Radiolaire -- Foraminifère
- Eukaryota (classification phylogénétique)
- Arbre phylogénétique
- Photo-guide taxinomique du monde végétal
- Répertoire général des ressources en botanique
