Codon d'initiation
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Le codon d'initiation ou codon initiateur est un triplet de nucléotides qui dirige l'initiation de la traduction protéique, il signal le début du message génétique sur un ARNm. Chez les Eucaryotes, ce codon est uniquement le triplet AUG qui code une méthionine (Met). Chez les Procaryotes, le codon initiateur est également AUG mais peu parfois être remplacé par le codon GUG et plus rarement UUG. Le codon AUG code chez les Procaryotes une formylméthionine (fMet). Il s'agit d'une méthionine dont le groupe aminé est formylé.
Sur le brin sens de l'ADN, la séquence du codon d'initiation est ATG. Chez les Eucaryotes, les nucléotides entourant le triplet initiateur ATG sont bien conservés et constituent une séquence nommée séquence consensus de Kozak. Cette séquence est 5’- GCCGCCRCCATGG -3’ où R est soit une adénine soit une guanine, elle permet l'association de l'ARNm sur la petite sous-unité du ribosome. La différenciation entre un triplet initiateur et un triplet codant une méthionine au sein de la chaîne CACA peptidique est favorisée par cette séquence. Chez les Procaryotes la séquence consensus qui permet la fixation de l'ARNm sur la petite sous-unité du ribosome est la séquence consensus de Shine-Dalgarno. La séquence de Shine-Dalgarno (5’- AGGAGG -3’) est à 7 bases en amont du codon AUG de l'ARNm. Comme nous l'avons vu plus haut, la méthionine codée par le codon initiateur est formylée sur le groupement aminé. Il existe donc deux types d'ARNt pour la méthionine procaryotes selon qu'elle est initiale ou interne. Dans ce dernier cas, elle n'est pas formylée.
La méthionine codée par le codon d'initiation est généralement enlevée juste après la synthèse de la chaîne peptidique.
Note : l'anglicisme codon start est à éviter dans la mesure où le terme français est largement répandu dans la littérature scientifique francophone.
