BLAST
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| BLAST | |
|---|---|
| Développeur | Altschul S.F., Gish W., Miller E.W., Lipman D.J., NCBI |
| Dernière version | 2.2.16 |
| Environnement | Multiplate-forme |
| Type | Outil bio-informatique |
| Licence | Domaine public |
| Site web | Serveur FTP de NCBI |
BLAST (acronyme de basic local alignment search tool) est un algorithme utilisé en bio-informatique permettant de trouver les régions similaires entre deux ou plusieurs séquences de nucléotides ou d'acides aminés. Ce programme permet de calculer significativement les pourcentages de similitude (parfois abusivement qualifiés de "pourcentages d'homologie") entre les séquences en les comparant avec des banques de données.
BLAST est utilisé pour trouver des relations fonctionnelles ou évolutives entre les séquences et peut aider à identifier les membres d'une même famille de gènes.
Sommaire |
[modifier] Histoire
Ce programme a été développé par Stephen Altschul, Warren Gish et David Lipman au National Center for Biotechnology Information (NCBI). La publication originale parue en octobre 1990, Basic local alignment search tool [1], a été citée plus de 20 000 fois, ce qui en fait l'une des plus citées dans le monde scientifique.
[modifier] Référence
[modifier] Voir aussi
[modifier] Lien externe
- (en) Site officiel
